अदालत ने वक्फ अधिनियम की धारा 3(आर) के प्रावधान पर रोक लगा दी, जिसके तहत किसी व्यक्ति को अपनी संपत्ति समर्पित करने से पहले पाँच साल तक मुसलमान होना आवश्यक है। पीठ ने कहा कि ऐसी धार्मिक प्रथाओं को सत्यापित करने के लिए कोई नियम या प्रक्रिया नहीं है, जिसके परिणामस्वरूप मनमाने फैसले हो सकते हैं।
अदालत ने जिला कलेक्टरों को निजी नागरिकों से संबंधित विवादों का फैसला करने का अधिकार देने वाले प्रावधानों पर भी रोक लगा दी, यह देखते हुए कि उन्हें ऐसा अधिकार देना शक्तियों के पृथक्करण के सिद्धांत का उल्लंघन होगा। न्यायालय ने इस बात पर ज़ोर दिया कि विवादों का निपटारा कलेक्टर के बजाय वक्फ न्यायाधिकरणों के माध्यम से किया जाना चाहिए।
सुप्रीम कोर्ट ने वक्फ बोर्डों में गैर-मुस्लिमों को शामिल करने संबंधी विवादास्पद प्रावधानों पर रोक नहीं लगाई, बल्कि इसकी एक सीमा तय की।
हालांकि, पीठ ने अधिनियम के तहत वक्फ संपत्तियों के पंजीकरण की शर्त पर रोक लगाने से इनकार कर दिया। न्यायाधीशों ने स्पष्ट किया कि 1995 से 2013 के बीच और नए संशोधन के तहत भी पंजीकरण वक्फ कानून की एक निरंतर विशेषता रही है।
न्यायालय ने स्वीकार किया कि पंजीकरण की अंतिम तिथियों में लचीलेपन की आवश्यकता हो सकती है, जिसका उसने अपने आदेश में उल्लेख किया है। इस अवसर पर, न्यायालय ने स्पष्ट किया कि उसकी टिप्पणियाँ केवल प्रारंभिक हैं और अंतिम बहस के दौरान मामले की विस्तार से जाँच की जाएगी।